Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXB9P17482 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms