Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GNB3P16520 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GNB3P16520 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms