Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCFC2P16383 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms