Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms