Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms