Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR2F1P10589 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms