Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CALM1P0DP23 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CALM1P0DP23 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms