Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC192P0DO97 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC192P0DO97 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms