Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMIGD3P0DMS9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMIGD3P0DMS9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms