Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C8orf88P0DMB2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C8orf88P0DMB2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms