Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB5P09067 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB5P09067 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms