Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSP90AB1P08238 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSP90AB1P08238 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms