Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CENPBP07199 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CENPBP07199 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CENPBP07199 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CENPBP07199 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms