Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRYBA1P05813 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms