Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
POLR1AO95602 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1AO95602 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1AO95602 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1AO95602 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POLR1AO95602 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1AO95602 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1AO95602 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms