Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF3JO75822 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms