Protein–RNA interactions for Protein: O75604

USP2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP2O75604 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP2O75604 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP2O75604 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP2O75604 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP2O75604 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP2O75604 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP2O75604 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP2O75604 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP2O75604 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms