Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF40AO75400 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF40AO75400 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms