Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPFIA4O75335 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPFIA4O75335 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms