Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE8AO60658 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE8AO60658 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms