Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSSCA1O60232 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSSCA1O60232 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms