Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
J3QQQ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms