Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L21D6R901 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms