Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRBOX1C9JBD0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms