Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI3A8MTJ6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms