Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF839A8K0R7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF839A8K0R7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms