Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRIM32Q13049 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRIM32Q13049 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms