Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms