Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
V9GYY5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYY5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYY5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYY5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYY5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms