Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAMTA1Q9Y6Y1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms