Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6I8

PXMP4, Peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4Q9Y6I8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PXMP4Q9Y6I8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms