Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PARP3Q9Y6F1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms