Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX8Q9Y5X2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX8Q9Y5X2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms