Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG4BQ9Y4P1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG4BQ9Y4P1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms