Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms