Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRPS28Q9Y2Q9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms