Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC8Q9Y2L5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms