Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM2AQ9Y2K7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms