Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KIAA1024Q9UPX6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms