Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms