Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJD2Q9UKL4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms