Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBE1Q9UJT0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms