Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NDUFA12Q9UI09 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms