Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO40Q9UH90 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms