Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DKK3Q9UBP4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms