Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HDAC6Q9UBN7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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