Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms