Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms