Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC88CQ9P219 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms