Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGEF12Q9NZN5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms